1921 : Le Jardin des chimères (poésie)
1922 : Les dieux ne sont pas morts (poésie)
1929 : Alexis ou le Traité du vain combat (roman), au Sans Pareil
1931 : La Nouvelle Eurydice (roman)
1932 : Pindare (essai)
1934 : Denier du rêve (roman)
1934 : La mort conduit l'attelage
1936 : Feux (poèmes en prose)
1938 : Les Songes et les Sorts
1938 : Nouvelles orientales, (nouvelles)
1939 : Le Coup de grâce (roman)
1951 : Mémoires d'Hadrien (roman)
1954 : Électre ou la Chute des masques
1956 : Les Charités d'Alcippe
1962 : Sous bénéfice d'inventaire (essai)
1962 : Ah, mon beau château
1963 : Le Mystère d'Alceste (théâtre)
1963 : Qui n'a pas son Minotaure ? 
1964 : Fleuve profond, sombre rivière (poésie, traduction de negro spirituals)
1968 : L'Œuvre au noir (roman)
1971 : Théâtre I (Rendre à césar, la Petite Sirène et le Dialogue dans le marécage) (théâtre)
1972 : Entretiens Marguerite Yourcenar et Patrick de Rosbo (entretien)
1974 : Le Labyrinthe du monde. I, Souvenirs pieux (récit)
1977 : Le Labyrinthe du monde. II, Archives du Nord (récit)
1979 : La Couronne et la Lyre (anthologie de poèmes traduits du grec ancien)
1980 : Les Yeux ouverts : entretiens avec Marguerite Yourcenar de Matthieu Galey (entretiens)
1980 : Mishima ou la Vision du vide, (Gallimard, essai)
1981 : Discours de réception de Madame Marguerite Yourcenar à l'Académie française
1982 : Comme l'eau qui coule (Anna, soror, Un homme obscur, Une belle matinée)
1982 : Si nous voulons encore essayer de sauver la Terre (conférence)
1982 : Sur quelques thèmes érotiques et mystiques de la Gita-Govinda - L'Andalousie ou les Hespérides (essai)
1983 : Le Temps, ce grand sculpteur
1984 : Blues et Gospels (poésie, traduction)
1984 : Cinq Nô modernes de Yukio Mishima (traduction)
1984 : Les Charités d'Alcippe, (poème)
1985 : Le Cheval noir à tête blanche (conte indien)
1987 : La Voix des choses
1988 : Le Labyrinthe du monde. III : Quoi ? L'Éternité (récit)
1988 : Les Trente-Trois Noms de Dieu - Le Livre d'Adresse
1989 : En pèlerin et en étranger (essai)
1991 : Le Tour de la prison (essai, voyages)
1992 : Écrit dans un jardin
1993 : Conte bleu - Le Premier soir - Maléfice (contes)
1995 : Lettres à ses amis et quelques autres (correspondance)
1999 : Sources II (essai)
1999 : Marguerite Yourcenar : Entretiens avec des Belges
2002 : Portrait d'une voix (entretiens)
2004 : D'Hadrien à Zénon - Correspondance 1951-1956
2007 : Une volonté sans fléchissement - Correspondance 1957-1960
2011 : Persévérer dans l'être - Correspondance 1961-1963

Oeuvres complètes :
1982 : Œuvres romanesques (Pléiade, Gallimard)
1991 : Essais et Mémoires (Pléiade, Gallimard)